为使WSP能够用于预测和管理具体的有害物及有害事件，WSP需有精确可信的技术信息支持。验证主要关注获取控制措施效果的证据。根据控制的种类，可通过实地考察、利用现有数据和文献或有针对性的检测项目来验证一般以及异常状况下控制过程的效果。
处理过程的验证要求表明处理过程可以按预期要求运行，并能够达到预期的减少危害的要求。在微生物危害中，所需要求通常基于对相关病原体的运行效果。验证可以在预试验阶段进行，也可以在实施新的或改造的水处理系统之初来进行。在优化现有处理过程上这也是有力的工具。
验证工作的第一步是考虑己有的资料数据和信息。其来源包括科学文献、相关行业机构、规章和法律部门、供水单位规定和历史资料等。从这一步可以得到测试的要求。验证中所用数据应当符合特定系统的条件，比如水体成分与质量的变化可能对控制措施的效率有很大影响。
验证并不用于饮用水供应的日常管理;所以可以采用可能不适用于运行监测的微生物学指标，尽管病原学检测要延后一段时间才得到结果，而且还需要一笔额外的花费，但这通常是可以接受的。要选择能反映特定工艺中的微生物信息的参数。指示参数越来越多地被运用于验证中。例如，大肠埃希氏菌噬菌体可被用于评估过滤或消毒对病毒去除的效率;产气荚膜杆菌可用于测量过滤对原虫的去除效率。
验证不应与日常运行监测混淆，后者的作用在于证明控制措施持续有效工作。验证过程通过确认最有效、最健康的操作模式，可以使运行操作得到有效改善。验证过程还能够为单元操作获得更合适的运行监测参数。
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