对于旅行者来说，通常病原体来自污染的饮用水和用受污染的水清洗的食物。腹泻是通过水感染的最普遍的症状，每年有20%~50%的旅行者或近1千万人受到感染。甚至发生在一些住在高档度假村和酒店的旅客身上。在世界上一些地区，自来水或瓶装水如果生产条件不当，即便外表是无色澄清的，也可能是不安全的。
没有什么疫苗能够预防由许多不同病原体引起的腹泻。因此旅行者应注意可能的危险性和采取适当措施，使受感染的可能性减到最小。在饮用水不安全的地区生活和旅行时，腹泻的预防措施包括以下几点:
.只饮用那些密封容器保存和瓶装的或是由知名制造厂商(最好由责任当局认证过)罐装的水或其他饮料(如碳酸饮料、巴氏杀菌过的果汁和牛奶)。可以从酒店的工作人员或当地居民那里了解到哪些当地品牌是安全的;
.饮用经过有效消毒(如煮沸、过滤或化学消毒)并储存在干净容器中的水;
.饮用如咖啡和茶这些热饮时，需用开水冲泡并且保温储存在干净的容器中;
.避免用不安全的水刷牙;
.除非是用安全的水做的冰块，否则不要食
.不食用可能用不安全水洗涤或制备的沙拉或其他未经烹调的食物。
旅行者可以对少量水进行处理以显著提高水的安全性。许多简单的处理方法和目前可获得的商业性技术也可用于旅行者以个人或家用为目的饮用水处理。旅行者需要选择一种水处理方法来去除或杀灭所有病原体。相关技术应得到有关部门的认证，制造商也应认真遵循指示操作。
将水煮沸是杀灭致病病原体最有效的方法，即使是在高海拔地区和只有浑浊水的时候。开水应该自然冷却而不应该加冰冷却。如果需要将水澄清，则应在水煮沸之前进行。
如果无法将水煮沸，那么在清澈、无浑浊的水中化学消毒剂能有效地杀死细菌和大多数病毒以及某些原虫(但不包括隐抱子虫的卵囊)。某些形式的氯和碘是旅行者最常用的化学消毒剂。在氯化或碘化消毒之后，用活性炭(木炭)过滤能够去除水中过量的味道和气味。对于长期供给婴幼儿、孕妇以及患有甲状腺疾病和对碘过敏的人的用水，不推荐使用碘化消毒，除非处理过程中包含有效的碘去除装置(如活性炭)。旅行者如果每天对所有的用水使用碘化消毒超过3-4周，应预先向医生咨询以保证不食用过量。银有时也充当一种消毒剂，但不推荐，因为其效果不确定，并且需要较长的接触时间。
水中的悬浮颗粒会降低消毒剂的效果，所以浑浊的水在消毒前应澄清或过滤。也可以使用一些通过聚集颗粒的化合物(混凝和絮凝来去除颗粒)配合氯化消毒。
可以采用经过检测和评定的便携式过滤装置，去除原生动物和一些细菌，也可以使用如陶瓷、膜(主要是反渗透)和活性炭过滤器。滤器的孔径必须<1um以确保去除隐抱子虫的卵囊。为了预防堵塞，使用这些非常微细的滤器时可能需要先过滤以去除大的颗粒物。
推荐使用联合的技术(例如先澄清或过滤，随后化学消毒)，除非水是沸腾的。这种联合技术为水处理过程提供了多重保障，去除大量的原生动物并杀灭细菌和病毒。
对于免疫系统功能低下的人群、孕妇及婴幼儿，建议采用额外的防范措施以减少受污染水感染的危险性(例如隐抱子虫的感染)。建议饮用沸腾并保存在容器中的水，经国际或国家认证的瓶装水和矿泉水也是可以饮用的。
这里所描述的处理方法，除了活性炭过滤和反渗透，通常不会降低饮用水中大部分的化学污染物水平。然而，通常不用担心这些方法的使用在短期内会影响健康。