由致病性细菌、病毒和寄生虫(例如原虫和蠕虫)引起的传染性疾病是与饮用水有关的最常见、最普遍的健康风险。这些传染病对公众健康的危害程度取决于病原体致病的严重程度和发生率、传染性及暴露人群。对于那些弱势群体，疾病的暴发可能更为严重。
供水安全发生故障(包括水源、处理和输配过程)可能引起大规模的污染并可能导致可以检测到的疾病暴发。有时，低水平、潜在重复的污染可能会导致严重的散发疾病，但是公众卫生监督部门未必认为与被污染的饮用水水源有关。
介水传播病原体有下列几个特性，使他们区别于饮用水中其他污染物:
.病原体可引起急、慢性健康影响。
.有些病原体能在环境中生长。
.病原体是离散的。
.病原体常常聚集或附着在水中的悬浮固体颗粒物上，且其浓度随时间变化，所以从水中病原体的平均浓度很难预测致使感染的剂量。
.暴露于病原体并导致疾病发生取决于病原体的量、侵袭性、毒力以及人体的免疫状态。
.如果感染发生，那么病原体将在宿主内倍
.某些水传播病原体也可以在食品、饮料或温水系统内繁殖，延续甚至增加传染的可能性。
.不像许多化学试剂，病原体并不产生一个累积效应。
通过致病性细菌、病毒、原虫和蠕虫产生的传染疾病是最常见最普遍的与饮用水有关的健康威胁。
微生物风险定量评估(QMRA)是一个用于评估来自人类致病菌的感染风险的数学模型，能够帮助了解和管理介水传播微生物危害，特别是那些散发疾病。
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